Ключова разлика: Коагулацията означава да се съсири; то основно се отнася до химически процес, при който се осъществява дестабилизирането на неразтворими частици. Тези частици образуват бучки с помощта на коагулант. От друга страна, флокулация означава образуване на флокули. Тя може да бъде описана като физически или механичен процес, при който коагулираните бучки или флокули се съединяват, за да образуват маси като облак и след това утайка.

Водата може да съдържа колоидни твърди вещества като неразтворима органична материя, глинести частици, бактерии, планктон, малки частици от разлагащ се растителен материал и т.н.
Коагулацията се постига чрез неутрализиране на частиците и по този начин отблъскващата сила между частиците се намалява значително. След използване на флокулационния процес, коагулираните частици образуват голяма агломерация, която също е известна като floc.

При флокулация тези агломерации от дестабилизирани частици имат формата на големи частици. Това може да се постигне и чрез добавяне на високомолекулни, водоразтворими органични полимери. Поради тези полимери размерът на флокулите се увеличава и след това частиците се утаят. Много е важно плавно смесване на флокулиращия агент при бавна скорост, така че малките кокили да могат лесно да се агломерират в големи частици и накрая да се успокоят.
За третиране на вода, коагулацията обикновено е последвана от флокулация.
По този начин, по отношение на пречистването на водата, и двете могат лесно да бъдат диференцирани. По време на коагулацията се добавя коагулант, за да се съберат частиците заедно. От друга страна, по време на флокулация, разтворът се смесва внимателно, така че малките бучки, образувани по време на коагулацията, се събират заедно и образуват по-големи бучки. Тези големи бучки лесно се успокояват и по този начин могат да бъдат разделени.